Microsoftが推奨するメーラーは何なのでしょうか？

誤認がかなりあります。

＞ Officeのソフトの機能を順次UWPのOneNoteに引き継いでいくという話を聞きました。

上記のような話はありません。

＞ OutlookもUWPアプリ(標準メールアプリ)に移行しようとしているのではないかと思うのです

現在 Main Stream で 提供されている Microsoft Office は クイック実行版と Microsoft Store 版です。

このうち Microsoft Store 版が UWP （Universal Windows Platform）が該当します。

そもそも Microsoft 推奨する という定義が不明です。

推奨される Email Client は Microsoft が推奨するものでは意味がなく、

その Email Service の提供者が 推奨するものを利用します。

Microsoft の 提供する Email Service、 Consumer 向けの Outlook.com,  Comercial 向けの Exchange Online では Outlook for Windows / Outlook for Mac / Outlook for Mobile / Outlook on The Web のいずれもがそれぞれの状況と環境に合わせて推奨されています。

たとえば、

Gmail では Gmail の Web Mail が推奨されていて、

それ以外の Email Client Software は 安全性の低いアプリと位置付けられています。

推奨ということであれば、Exchange アカウント（Exchange Server, 法人向け Office 365 の Exchange Online) には Microsoft Outlook の利用が最適であるとされていますね。

それ以外のメール システムについては、特に言及はありませんが、Microsoft の提供しているメール クライアント（Outlook, Outlook Mobile, Windows 10 のメール アプリ）は総じて、POP アカウントはあまりお勧めされていない印象（実際に、使い勝手が良いとは言えない）ですね。POP アカウントしか使っていないのであれば、Microsoft 製以外のメール クライアントを使った方が良いでしょう。