Word 2010 の上書き保存のトラブルですが、現象の再現性はありますか?
既存文書の変更を行っているにもかかわらず、上書き保存しても反映されていなかったり、保存しないで終了を指定時に更新の確認ダイアログが表示されずに終了してしまい、変更が反映されていない場合の原因ですが、インターネット一時ファイルの場所とレジストリの設定に矛盾が生じていると同じ現象が発生することがあるようです。
一時ファイルの場所を変更した、Internet Explorer 以外のブラウザを既定で使用した場合などに、この矛盾が発生することもあるようなので、現象が再現するようであれば、以下の情報にあるようにレジストリの矛盾を解消する操作を行ってみてはどうでしょうか。 Word 2007/2010 で上書き保存されない [Word]